Mejores programas de facturación en 2026: comparativa y guía completa para autónomos y empresas

Descubre los mejores programas de facturación y software de facturación para autónomos y pymes en 2026. Compara funcionalidades, precios y beneficios, y encuentra la herramienta ideal para tu empresa.
cuenta autónomo

La gestión financiera de cualquier empresa depende de tener un control claro de ingresos, gastos y facturas emitidas. En pleno 2026, los programas de facturación se han convertido en herramientas indispensables tanto para autónomos como para pymes, permitiendo no solo emitir facturas, sino también gestionar pagos, controlar impuestos y automatizar procesos.

→ Entre los mejores programas de facturación destacan:

  1. 🥇 Más completo para pymes: Holded
  2. 🥈 Mejor para autónomos: FacturaDirecta
  3. 🥉 Más sencillo y económico: Billin
  4. 🏢 Para empresas más grandes: Sage 50
  5. 🌍 Opción open source potente: Odoo

Si buscas automatización, cumplimiento legal y escalabilidad, evita soluciones básicas y apuesta por un software adaptado a la normativa vigente.

Es fundamental que sepas que, según el reglamento de la Ley Antifraude, si eres autónomo persona física, el 1 de julio de 2026 es tu fecha límite. A partir de ese día, será obligatorio que tu software de facturación esté adaptado al sistema Verifactu para remitir los registros de facturación de forma automática y segura a la AEAT.

✅ Un software de facturación eficiente debe permitir emitir facturas electrónicas conforme a la normativa vigente, integrarse con tu contabilidad y facilitar reportes financieros en tiempo real. Además, la escalabilidad y la seguridad de los datos son esenciales, sobre todo si tu empresa crece o maneja información sensible de clientes. Al elegir este software, asegúrate de que ya dispone de la declaración responsable del fabricante. Este documento garantiza que la herramienta cumple con los requisitos de integridad, conservación y trazabilidad que exige Hacienda para este año 2026.

En esta guía, te explicaré qué ofrecen los principales programas de facturación y cuál puede ser el mejor, comparando entre sus características y ayudándote a encontrar la mejor opción que puedes contratar para tu negocio.

Comparativa de los mejores softwares para empresas y autónomos

EntidadQué ofreceComisiones y condiciones
Holded- Permite conectar ventas, inventario, CRM y proyectos con la contabilidad en tiempo real

- Cuadros de mando intuitivos

- Automatización de Conciliación Bancaria
A partir de 7,50 €/mes.
Quipu- Extrae datos de tickets y facturas mediante IA

- Genera borradores de modelos tributarios

- Acceso compartido entre el departamento financiero y la gestoría externa
Desde 8,5 €/mes
Sumup- Integración total de herramientas, combinando facturación, pagos digitales, y cuentas de empresa.

- Coste por transacción de 0,75 %

- Integración son sistemas de venta en línea
Desde 0 € al mes
Sage- Capacidad de generar informes financieros complejos y personalizados que cumplen con estándares de auditoría internacionales.

- Sincronización con Excel y Office 365.
Desde 45€ mes
Billin- Notificaciones en tiempo real cuando el cliente recibe, visualiza o descarga la factura

- Pasarela de Pagos Integrada

- Automatización de facturas periódicas
Desde 6,6 €/mes
Contasimple- Cálculo Automático de Retenciones

- Gestión Documental en la Nube

- Exportación inmediata de libros de facturas emitidas, recibidas y bienes de inversión
Desde 0 €/ mes
Odoo- Módulo de facturación conectado automáticamente con ventas

- Procesamiento de documentos contables mediante inteligencia artificial

- Personalización avanzada con modelos de factura a medida

- Herramientas de firma digital integradas
Desde 0 €/ mes
Factura Directa- Cumplimiento legal garantizado

- Digitalización inteligente de gastos

- Soporte para factura electrónica y firma digital
Desde 0 €/ mes

Mejores programas de facturación en España

Los mejores programas de facturación de 2026 combinan facilidad de uso, compatibilidad con facturación electrónica, integración contable y soporte técnico fiable. Para elegir el adecuado, prioriza software que ofrezca actualización automática de impuestos, plantillas personalizables y control de clientes y proveedores.

A continuación, te hago un resumen de los mejores softwares de facturación de España, teniendo en cuenta y analizando todos estos criterios:

HOLDED

Holded es un software de gestión en la nube (ERP) diseñado específicamente para pymes, autónomos y asesorías. Su objetivo principal es centralizar todas las necesidades de gestión de una empresa en una sola plataforma intuitiva, sustituyendo los procesos manuales por la automatización de tareas para ganar control y tiempo.

  • Centraliza toda la gestión de tu negocio en una única plataforma en la nube.
  • Automatiza tareas diarias permitiendo un ahorro de hasta 40 horas mensuales.
  • Crea facturas profesionales rápidamente con más de 50 plantillas personalizables.
  • Simplifica el cumplimiento fiscal mediante la automatización de impuestos y conciliación bancaria

  • El acceso completo requiere un pago mensual tras finalizar el periodo de prueba o promoción.
  • Al ser un software íntegramente en la nube, es imprescindible tener conexión para trabajar

Ahora tienen una promoción con la que puedes probar la plataforma sin coste durante 14 días, ofreciéndote además un ahorro del 50% durante 3 meses en cualquiera de sus packs. Lo tienes para autónomos desde 7,50 € al mes y para empresas desde 14,40 € al mes.

QUIPU

Quipu es una solución integral de facturación y tesorería en la nube diseñada para autónomos, empresas y asesorías. Su plataforma permite centralizar la información financiera, automatizar tareas repetitivas y cumplir con las normativas fiscales españolas, como Verifactu, de forma fácil e intuitiva.

  • Permite crear facturas profesionales en segundos y conciliar movimientos bancarios automáticamente.
  • Puedes registrar y contabilizar tickets de gasto con tan solo hacerles una foto desde el móvil.
  • La herramienta ya está adaptada a Verifactu y genera modelos fiscales listos para descargar.
  • Incluye Genius AI para resolver dudas al instante sobre impuestos, facturación y el uso del programa.

  • El plan inicial solo incluye 30 escaneos mensuales del lector automático, lo que puede ser insuficiente para negocios con muchos tickets.
  • Herramientas clave como la conciliación bancaria automática o la analítica de proyectos solo están disponibles en los planes de mayor precio.
  • El soporte directo por chat o teléfono no es de 24 horas, estando restringido a horarios de oficina específicos de lunes a viernes.

En su promoción inicial, ofrecen un periodo de prueba gratuito de 15 días. A partir de ahí, tienen activo un 50% de descuento durante los 3 primeros meses posteriores con todas sus funcionalidades.

Los precios varían en función de los meses de contratación, ofreciendo packs mensuales (ahora con descuento) o anuales, con precios desde los 8,50 € al mes una vez finalizado el periodo de promoción.

SUMUP

SumUp es una plataforma de servicios financieros, regulada por el Banco Central de Irlanda, que ofrece un software de facturación integrada como parte de su ecosistema digital. Esta herramienta permite a los negocios gestionar pedidos, emitir facturas y controlar sus finanzas de manera sencilla a través de una aplicación gratuita.

  • Comisiones transparentes y bajas, con un coste por transacción de tan solo el 0,75 %.
  • Integración total de herramientas, combinando facturación, pagos digitales, reservas y cuenta de empresa.
  • Compatibilidad flexible, permitiendo integrarse con sistemas de venta en línea que el negocio ya utilice.
  • Gestión financiera acelerada, con apertura de cuenta en minutos y depósitos de dinero en 3 horas.

  • La recepción de fondos en 3 horas está sujeta a disponibilidad técnica y a la ausencia de actividades sospechosas o contracargos.
  • Las tarifas especiales y personalizadas solo están disponibles para negocios que facturen más de 10.000 € al mes.
  • Los precios mostrados no suelen incluir el IVA y la garantía de reembolso de dinero está limitada a los primeros 30 días

En cuanto a los precios, tienen pack de pago por uso desde 0 € al mes, con una comisión por transacción en persona de 1,49 %. Se pueden reducir las comisiones a 0,75 % con la tarifa Pagos Plus, desde 19 € al mes.

SAGE

El software de facturación de Sage consiste en soluciones en la nube diseñadas para automatizar el seguimiento de efectivo, la facturación y los informes financieros de empresas de todos los tamaños.

Utiliza agentes de IA para minimizar tareas manuales, detectar errores en los registros y proporcionar visibilidad de los datos en tiempo real. Además, ofrece herramientas específicas para diversas industrias como la construcción, salud y comercio minorista, permitiendo un escalamiento eficiente del negocio.

  • Automatiza hasta el 90% de las tareas de entrada de datos y generación de informes mediante inteligencia artificial.
  • Ofrece más de 500 modelos de facturación y reportes especializados para adaptarse a las necesidades de sectores específicos como el de suscripción (SaaS).
  • Acelera los cierres financieros mensuales mediante asistentes virtuales que gestionan tareas pendientes y señalan problemas automáticamente.
  • Integra el seguimiento de tiempo de correos y reuniones para crear hojas de horas y facturaciones precisas de forma automática

  • La alta capacidad de personalización de sistemas como Sage X3 puede requerir una configuración técnica más compleja y especializada.
  • Las funciones más avanzadas de IA y automatización continua están centradas principalmente en productos específicos como Sage Intacct.
  • La gran variedad de versiones puede dificultar a los usuarios la elección de la herramienta más adecuada para su tamaño inicial

En cuanto a precios, Sage es una plataforma escalable a las necesidades de tu negocio. Los planes van desde 45 € al mes, y puedes pagarlos tanto mes a mes como de forma anual.

BILLIN

Billin es un programa de facturación online diseñado para autónomos y pymes que permite gestionar de forma integral facturas, presupuestos, albaranes y tickets en segundos. La plataforma asegura el cumplimiento con la normativa Verifactu y la Ley Antifraude, facilitando además la transición a la factura electrónica obligatoria. Incluye herramientas avanzadas como lector OCR de gastos, control de stock e integración directa con tiendas Shopify y gestorías.

  • Cumplimiento legal garantizado: Está adaptado a la normativa Verifactu y preparado para la factura electrónica obligatoria de los próximos años.
  • Automatización eficiente: Permite crear facturas en menos de un minuto y digitalizar gastos automáticamente mediante su sistema de lectura OCR.
  • Gestión centralizada y real: Ofrece control de stock, supervisión de ingresos/gastos en tiempo real y conexión directa con tu gestor.
  • Permite adaptar los documentos a tu imagen corporativa y gestionar el negocio desde cualquier lugar mediante su app móvil.

  • El acceso total a todas las funcionalidades avanzadas está restringido a una prueba gratuita de 30 días.
  • Al ser un software estrictamente online, requiere una conexión a internet estable para acceder a los datos y emitir documentos.
  • Su diseño está optimizado para autónomos y pymes, por lo que puede carecer de módulos de ERP complejos necesarios para grandes empresas

Actualmente, tienen activa una prueba gratuita durante 30 días con todas las funcionalidades. Una vez pasado ese periodo, tiene planes mensuales o anuales (ahorras un 17%) desde los 6,6 € al mes

CONTASIMPLE

Contasimple by Cegid es un software de gestión en la nube diseñado para autónomos y pequeñas empresas que simplifica la facturación, el control de stock y la presentación de impuestos.

La herramienta permite a los usuarios gestionar su negocio de forma independiente (filosofía "hazlo tú mismo") y cumplir con la normativa Verifactu mediante una plataforma accesible desde la web o dispositivos móviles.

  • Plan gratuito para siempre con acceso a funcionalidades esenciales de gestión integral para el negocio,.
  • Automatización fiscal completa que genera modelos de IVA e IRPF automáticamente y sin errores de cálculo.
  • Digitalización de gastos mediante OCR que permite registrar tickets y facturas desde el móvil eliminando el papel.
  • Gestión de inventario en tiempo real con alertas automáticas cuando el stock está bajo para evitar roturas.

  • Solo permite emitir 12 facturas al año y gestionar un máximo de 5 productos.
  • Todos los planes detallados (Básico, Profesional y Ultimate) están limitados a un solo usuario.
  • Para obtener facturas y productos ilimitados es obligatorio contratar el plan Ultimate, el más caro de la gama

Contasimple By Cegid cuenta con un plan de regalo de 30 días con todas las funcionalidades de la herramienta gratuitas. Una vez pasado ese periodo, hay varios planes, incluso desde 0 € el más básico, con opción a contratación trimestral o anual (ahorras un 20% contratando el anual en los packs de pago), dependiendo de las funcionalidades que requiera tu empresa.

ODOO

Odoo es una plataforma de gestión empresarial de código abierto que integra en un único ecosistema aplicaciones de facturación, contabilidad y firma electrónica, permitiendo automatizar el ciclo de cobro y reducir el procesamiento de documentos de días a solo unas horas.

  • El módulo de facturación se conecta automáticamente con ventas, CRM y contabilidad para evitar la entrada doble de datos.
  • Reduce drásticamente las tareas manuales y agiliza el procesamiento de documentos contables mediante inteligencia artificial.
  • Permite diseñar pantallas y modelos de factura a medida, además de automatizar acciones mediante Odoo Studio.
  • Incluye herramientas de firma digital integradas para dar validez legal a contratos y facturas de forma rápida

  • La edición "Community" carece de las aplicaciones adicionales y la infraestructura profesional que ofrece la versión "Enterprise".
  • Para implementaciones complejas, la plataforma recomienda contratar partners o asesores, lo que puede elevar el coste inicial.
  • Aunque el precio incluye todas las aplicaciones, el acceso a la infraestructura avanzada requiere un pago mensual por cada empleado.

Con respecto al precio, puedes empezar a usar Odoo de forma totalmente gratuita, ya sea porque usas la versión free o aprovechando la prueba gratuita que tienes disponible para cualquiera de sus packs de pago.

FACTURA DIRECTA

FacturaDirecta es un programa de gestión en la nube para autónomos y pymes que permite crear facturas profesionales en segundos y está certificado para cumplir con la normativa VeriFactu. El software se encarga de automatizar la facturación electrónica mediante el envío automático a la Agencia Tributaria y la incorporación obligatoria de códigos QR en los documentos.

  • Cumplimiento legal garantizado al adaptarse automáticamente a los requisitos de VeriFactu y la Ley Antifraude.
  • Automatización integral del flujo de trabajo, generando la contabilidad y los modelos de impuestos de forma automática al facturar.
  • Digitalización inteligente de gastos mediante un sistema de lectura OCR que extrae los datos de tickets y facturas automáticamente.
  • Soporte para factura electrónica y firma digital, permitiendo emitir documentos con validez legal y en formato "facturae".

  • Limitaciones extremas en la versión gratuita, que solo permite gestionar hasta 10 clientes y 10 productos, además de no incluir firma digital.
  • Funciones de conectividad restringidas, ya que el enlace con bancos y las integraciones con otras apps vía Zapier solo están disponibles en los planes de pago más altos.
  • Acceso exclusivo a la contabilidad completa, puesto que las herramientas de contabilidad online solo se ofrecen en el "Plan Total", el nivel más costoso de la plataforma.

FacturaDirecta ofrece un plan gratuito (0 €) y tres niveles de pago anual: Básico (10 €/mes), Avanzado (20 €/mes) y Total (40 €/mes), todos más IVA. El coste escala según el límite de clientes y productos (de 10 a ilimitados) y el acceso a funciones de seguridad como la firma digital de documentos. Los planes superiores integran herramientas avanzadas como conexión bancaria, automatización mediante Zapier y un sistema de contabilidad online profesional.

¿Cuál es el mejor programa de facturación para empresas?

No existe un único mejor programa de facturación para todas las empresas, sino una solución más adecuada según el tamaño, las necesidades y el momento en el que se encuentre el negocio.

Si hablamos de la opción más completa para pymes, Holded destaca por su equilibrio entre automatización, control financiero y escalabilidad. Es ideal para empresas que ya necesitan algo más que facturación básica y buscan una herramienta que acompañe su crecimiento.

Para quienes trabajan por cuenta propia, el mejor para autónomos suele ser FacturaDirecta, gracias a su simplicidad, claridad en la gestión de impuestos y facilidad de uso sin curva de aprendizaje compleja.

Si el objetivo es empezar con algo funcional, intuitivo y económico, Billin es una de las alternativas más sencillas y accesibles del mercado.

En el caso de empresas más grandes, con estructuras contables más avanzadas, Sage 50 ofrece una gestión mucho más profunda y profesional.

Por último, si se busca una opción open source potente y flexible, Odoo permite personalización y escalabilidad prácticamente sin límites.

En definitiva, el mejor software de facturación será el que encaje con tu volumen de facturación actual y tu previsión de crecimiento. Elegir con visión estratégica evita cambios futuros y optimiza costes a largo plazo.

Beneficios de la Facturación Electrónica

La facturación electrónica va mucho más allá de emitir facturas en digital. Utilizar un buen software de facturación permite automatizar tareas administrativas, reducir errores y cumplir con la normativa vigente sin complicaciones.

Entre sus principales beneficios destacan:

  1. Ahorro masivo de tiempo operativo
  2. Mejora inmediata del flujo de caja
  3. Cumplimiento legal automático y reducción de riesgos
  4. Control financiero en tiempo real
  5. Integración total con el ecosistema digital
  6. Escalabilidad
  7. Profesionalidad e imagen de marca
  8. Sostenibilidad y reducción de costes indirectos
  9. Seguridad y respaldo automático
  10. Reducción de errores humanos

Además, los programas de facturación ofrecen acceso a datos financieros actualizados, lo que facilita la toma de decisiones, la previsión de impuestos y el análisis de rentabilidad. También mejoran la imagen profesional del negocio y permiten escalar fácilmente a medida que la empresa crece.

La facturación electrónica ya no es una opción “moderna”: es una herramienta estratégica para cualquier negocio.

Adoptar un buen software de facturación significa:

  • Menos tareas administrativas
  • Más control financiero
  • Mayor seguridad legal
  • Mejor imagen profesional
  • Capacidad real de crecimiento

En 2026, no se trata de si debes usar facturación electrónica, sino de qué programa de facturación elegir para hacerlo bien desde el principio.

Preguntas Frecuentes

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